磁盘目录下的资源库中的东西能删吗？

“误删导致中毒”没有这种关系。“删除”东西后导致中毒，至今没有听说过，除非这个“删除”动作是把安全保障机制给删了。

隐私安全？根目录下的资源库，i.e. "/Library"， 那里面的确是有个保存全局的隐私安全数据库，是这样，这个库中包含着被准许和拒绝的应用的信息。删除后等于是空白，那些原来被拒绝或者准许的应用，当用到访问诸如截屏等操作的时候，macOS会再次提醒你，你再决定是否拒绝还是准许就可以了。

有的能刪, 有的不能, 不是非常了解用途的情況下不建議手動刪

是的，等到用时自然会有各种问题/现象出现。

覆盖安装系统

誤刪了不用檢測, 等出了問題你自然會感覺到, 如果不出問題就照常用